Село Заграђе смјештено је у источном дијелу БиХ, у области средњег Подриња, на тромеђи општина Милићи, Власеница и Хан Пијесак. Са сјеверне и сјевероисточне стране омеђено је Великом Сикиром (1070 m) и Малом Сикиром, са источне стране Комићем (1031 m), са југоисточне стране Лисином (1219 m) и са јужне стране Врховима (1315 m) и Стругом (1195 m). Са југозападне стране је област Краљеве Горе и природна веза са планинским дијелом Романије. Заштићеност врховима ствара посебне микроклиматске услове; са југа не допиру топле ваздушне масе због планинског масива Велики Жеп (1537 m), па се клима може окарактерисати као субпланинска и континентална.
Заграђе лежи на надморској висини од 585 m у Подстругу до 852 m на Станковом брду. Изглед села подсјећа на полуотворену књигу чијом средином тече ријека Лукавица. Лукавица сакупља изворишта и воде из Краљеве Горе и падина Струга и Врхова, пробија се између стрмих литица Комића и Мале Сикире и одлази даље у правцу сјевера гдје се улијева у ријеку Јадар у Подгори код Милића. Овај простор, у ширем смислу, карактеристичан је по контактима вододрживих стијена (шкриљаца) и водопропусних стијена (кречњака) на чијим контактима се јављају извори и врела. То је видљиво и на карти, гдје се са јужних обронака Струга и Врхова формирају бројни водени токови. /топографска карта/

Овај простор, у геолошком смислу, богат је налазиштима боксита, кварцита и кварцног пијеска. На обронцима планине Јавор налазишта су романита (врста мермера). Биљни и животињски свијет типичан је за регију Бирча. Велики су комплекси мјешавина црногорице (јела-abies alba, смрча-picea abies, бор бијели и црни-pinus sylvestris, pinus nigra, храст китњак и цер-qvercus petraea, qvercus cerris, црни граб-ostrya carpinifolia, бреза-betula pendula, јавор-acer pseudoplatanus, јасен-fraxinus excelsior, јовабијела и црна-alnus incana, alnus glutinosa, дивља трешња-prunus avium, дивља крушка-pyrus pyraster, дивља јабука-malus sylvestris... ) . Животињске врсте су: вук, лисица, срна, дивља свиња, зец, и бројне друге.